快三开奖结果一定牛

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                大咖直播要點回顧|CNV-seq的應用規範與臨床實踐
                2020.04.26

                2020年4月22日,北京快3聯合丁香園推出了大咖直播課程第三期——CNV-seq的應用規範與臨床實踐,第三期直播大咖——雲南省第一人民醫院醫學遺傳科朱寶生教授,朱寶生教授就《CNV-seq檢測技術在產前診斷中的應用:規範與臨床實踐》進行專題講座。

                現對本次課程進行要點回顧及總結,以期為廣大讀者朋友們提煉大咖觀點概要,話不多說,上幹貨~(文末有重彈)


                要點一|產前診斷CNV是防止出生缺陷的重要手段

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                出生缺陷病因中,遺傳因素約占40%,環境因素約占5-10%,遺傳因素與環境因素共同作用產生的不明原因約占50%。遺傳因素中,染色體非整倍性及大片段異常占比58%以上,染色體微缺失微重復占比24%,嚴重的單基因病占比17%[1]。其中,染色體非整倍體及大片段異常以及染色體微缺失/重復實際都與拷貝數變異(CNV)密切相關。Sebat等[2]研究發現人類基因組5%~10%的區域存在CNV,遠高於其他遺傳變異形式,而外顯子僅占人類全基因組的1%。朱教授強調,兒童(尤其是智力發育遲緩兒童)中約有22%~25.8%的病患是由致病性CNV和可能致病的CNV引起的,同樣遠高於其他遺傳變異形式。


                要點二|“新”比“芯”,精準度更勝一籌

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                產前診斷技術“全”體現在全基因組範圍內的全面檢測“精”體現在分辨率更高檢測更為精細化。全基因組範圍內的CNV檢測主要有NGS和CMA兩種方案,應用上雖各有優勢及局限,但CNV-seq作為基於NGS檢測技術的全基因組低深度測序,可突破CMA、MLPA和BoBs等技術因分辨率和設計原理自身的局限性,均勻檢測分布在基因組中任何片段和位點的CNV,故準確性更高、檢出效率更好,並在嵌合體——產前診斷尤為關註的遺傳現象的檢出上,CNV-seq確實更勝一籌。嵌合比例>30%情況下,CMA檢出相對準確,而CNV-seq可檢測低至10%的嵌合體,理想條件下,甚至可檢測5%的低比例嵌合體。


                要點三|CNV-seq與核型的強強聯合


                本次課程在提問區熱議的話題之一,就是高精度的CNV-seq是否會替代核型等常規檢測?從技術本身而言,CNV-seq不是為取代核型而存在,但卻可與核型強強聯合。核型作為臨床常規首選檢測,可過濾大部分整倍體/非整倍體及大片段CNV,對核型結果正常的受檢者應用CNV-seq檢測,可與核型形成技術補充,提高陽性檢出率。因CNV-seq具備低樣本量的優勢,若能同時進行核型+CNV-seq檢測,便可大幅提高受檢者陽性檢出率。

                一項應用CNV-seq進行大規模人群產前診斷[3]的研究中,有1,875例產前診斷指征的孕婦在超聲引導下,根據孕周分別選擇進行絨毛活檢、羊膜腔穿刺或臍靜脈穿刺,取材後送檢染色體核型分析和全基因組拷貝數變異檢測,共診斷致病性染色體核型及CNV異常179例,總陽性診斷率為9.55%(179/1,875),其中單獨染色體核型異常率為8.48%(159/1,875),單獨CNV異常率為7.68%(144/1,875)。所以,染色體核型分析聯合CNV-seq技術,有效提高了產前診斷異常診斷率,預防嚴重出生缺陷胎兒出生。


                要點四|準確檢出是前提,數據分析才是關鍵


                隨著2019年《低深度全基因組測序技術在產前診斷中的應用專家共識》及CNV致病性評級分級新指南的發布,都旨在說明檢出變異只是前提基礎,數據分析才是助力產前精準診斷的關鍵!


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                較2011年CNV致病性評級指南相比,分級體系由3級精細為5級,即致病(P)、可能致病(LP)、不確定意義變異(VUS)、可能良性(LB)、良性(B)。

                致病性判讀引入了量化的打分體系ClinGen,即支持分數加減、最後總分判斷。

                · ≥0.99分:致病變異(P)

                · 0.98~0.90分:可能致病變異(LP)

                · 0.89~-0.89分:不確定意義變異(VUS)

                · -0.90~-0.98分:可能良性(LB)

                · ≤-0.99分:良性(B)

                打分體系引入分子遺傳知識相關的評價標準:基因數量、位置、劑量;分別對拷貝數丟失和拷貝增加賦予了差異化的量化打分系統,拷貝數變異涉及的已知表型和受檢者表型的相符程度都作為數據分析時參考因素。




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                參考文獻


                1. Evans M I , Wapner R J , Berkowitz R L . Noninvasive prenatal screening or advanced diagnostic testing: caveat emptor[J]. American Journal of Obstetrics & Gynecology. 2016 Sep; 215(3): 298-305.

                2. Sebat J et al. Application of ROMA (representational oligonucleotide microarray analysis) to patients with cytogenetic rearrangements. Genet Med. 2005 Feb; 7(2):111-8.

                3. 龍喜貴,覃婷,莫偉英,等. 1875例孕婦產前遺傳學診斷結果與產前診斷指征分析[J]. 實用醫學雜誌, 2019, 35(10):110-114.

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